El Institut Borja de Bioètica se fundó en el año 1976 por iniciativa del Dr. Francesc Abel i Fabre, s.j., doctor en medicina, especialista en obstetricia y ginecologia, licenciado en filosofía y teología, y formado como investigador en los Estados Unidos, quién consideró fundamental la creación en Catalunya del primer centro de bioética del Estado Español.

Tras 8 años adscrito a la Facultat de Teologia de Catalunya, el Institut se constituyó como Fundación Privada en el año 1984 y figura inscrito en el Registre de Fundacions de la Generalitat de Catalunya con el número 125.

Desde el año 2000 es Institut Universitari por su integración en la Universitat Ramon Llull como entidad federada de pleno derecho.